Нужно ли формировать чек на приход денежных средств от сотрудника в организацию?

Яна, здравствуйте.
Выдача денежного займа сотруднику не является расчетом, при котором нужно применять ККТ (если этот займ не относится к займам за оплату товаров, работ, услуг).
А значит пробивать чек не требуется ни при выдаче, ни при погашении такого займа. Аналогичный вывод содержится в письме Минфина № 03-01-15/71891 от 18.09.2019.

При этом не забудьте в рамках бухгалтерского учета сформировать расходный кассовый ордер при выдаче займа и приходный кассовый ордер при возврате займа. ПКО и РКО - это документ первичной учетной документации кассовых операций в организации. Касса организации и ККТ не тождественны