Возможно ли возмещение клиентом НДС (резидент Сколково)?

Добрый день,
Согласно п. 1 ст. 145.1 НК РФ, организация, получившая статус участника проекта «Сколково», имеет право на освобождение от НДС, в течение 10 лет со дня получения ею такого статуса. В связи с этим, операции по реализации товаров (работ, услуг), совершаемые указанной организацией, НДС не облагаются (Письмо ФНС РФ от 21.04.2020 N СД-4-3/6667@).

При этом, организации-участники проекта «Сколково», освобожденные от НДС на основании ст. 145.1 НК РФ, должны составлять счета-фактуры, в которых указана надпись «без НДС» (Письма МФ РФ от 22.06.2023 N 03-07-09/58110, от 12.12.2022 N 03-07-09/121692).

Если организация-участник проекта «Сколково», освобожденная от НДС, выставила покупателю (заказчику) счет-фактуру с выделенной суммой НДС, то она должна уплатить НДС и представить декларацию по НДС не позднее 25-го числа месяца, следующего за кварталом, в котором произведена реализация товаров (работ, услуг) с начислением НДС.

Что касается вычета НДС покупателем (заказчиком) по счету-фактуре с выделенной суммой НДС, выставленном организацией-участником проекта «Сколково», освобожденным от НДС, то в соответствии с официальной позицией – права на вычет НДС нет, поскольку данный счет-фактура оформлен с нарушением порядка, установленным пп. 2 п. 5 ст. 169 НК РФ (Письма МФ РФ от 05.10.2015 N 03-07-11/56700, от 16.05.2011 N 03-07-11/126, от 29.11.2010 N 03-07-11/456, от 01.04.2008 N 03-07-11/126, от 24.10.2007 N 03-07-11/516, ФНС РФ от 06.05.2008 N 03-1-03/1925, от 17.05.2005 N ММ-6-03/404@).

Справедливости ради надо отметить, что имеется Письмо МФ РФ от 23.01.2020 N 24-01-08/3874 и Постановление КС РФ от 03.06.2014 N 17-П с выводами о том, что счет-фактура, выставленный с выделенной суммой НДС лицом, не являющимся плательщиком НДС, а также налогоплательщиком, освобожденным от обязанностей плательщика НДС, является основанием для принятия покупателем (заказчиком) суммы НДС к вычету.

С уважением, А. Грешкина