Добрый день,
Налоговые инспекторы не вправе отказать в приеме 2-НДФЛ только из-за того, что в справке не указан ИНН работника. Такой вывод следует из письма ФНС России от 27.01.16 № БС-4-11/1068@.
Следовательно, ВЫ можете не указывать ИНН в справке.
Форма 2-НДФЛ "Справка о доходах физического лица" находится в приложение N 1 к приказу ФНС РФ от 30.10.2015 N ММВ-7-11/485@). Согласно Порядка заполнения справки, в разделе 2 указываются данные о физическом лице. В поле "ИНН в Российской Федерации" указывается идентификационный номер налогоплательщика - физического лица, подтверждающий постановку данного физического лица на учет в налоговом органе Российской Федерации. При отсутствии у налогоплательщика ИНН данный реквизит не заполняется.
С уважением, Светлана

Да, это правило относится и к заполнению справок 2-НДФЛ за 2016г. Что касается ежеквартального заполнения отчета, то расчет 6-НДФЛ должен содержать обобщенную налоговым агентом информацию по всем физическим лицам, которые получили от него доход. В расчете указываются: суммы выплаченных доходов, предоставленных налоговых вычетов, исчисленного и удержанного НДФЛ и другие данные (новая редакция п. 1 ст. 80 НК РФ). В отличие от справки 2-НДФЛ новый расчет нужно сдавать не за каждого работника, а в целом по организации.
И еще.. Работнику все таки посоветуйте обратиться с заявлением о предоставлении ему ИНН. Если налоговая ему откажет на основании каких-то фактов, то тогда уже и нужно будет решать эту проблему сообща.
С уважением, Светлана