Добрый день, Алексей! Директор может получить один сертификат подписи от налоговой с данными организациями, и неограниченное количество сертификатов на себя как на физлицо. Отмечу, что с сертификатом физлица он сможет подписывать личные документы (т.е. как физлицо, не от имени организации).
Если не нашли ответа на свой вопрос — воспользуйтесь поиском или задайте новый.