Не выбили чек на аванс, но выбили чек на полный расчет с учетом предоплаты. Что делать?

Полина, добрый день.
Такой чек нужно исправить.
Ошибки в чеках исправляют чеками коррекции (в ФФД 1.1 и 1.2), либо обычными чеками на возврат (в ФФД 1.05) - это правила, утвержденные методическими рекомендациями ФНС.
У нас есть подробная статья Возврат или коррекция? Исправляем ошибки в кассовых чеках, в ней описаны нюансы исправлений.

В вашем случае способ оплаты "встречное предоставление" не подойдет. Так как именно в способе оплаты вы и допустили ошибку, которую нужно исправить.
Поэтому в чеке Возврат прихода укажите такой же способ, как и в чеке с ошибкой «зачет аванса». А в исправляющем чеке укажите корректный вариант оплаты "безналичными".
Таким образом в ФНС уйдет корректная информация об оплате, и у вас в учете будет все корректно.

ФНС уведомляют, если работаете на ФФД 1.05
на ФФД 1.1 и 1.2 чек коррекции - это и есть тот документ, который уведомляет ФНС, дополнительно ничего делать не нужно.

Хорошего дня