Нужно ли пробивать чек при оплате остатка по кредиту через расчетный счет, если первая часть оплачена наличными?

Анатолий, добрый день.
Логика рассуждений всегда такая:
Чтобы принять решение, формировать или нет чек важно понять, с кем происходит расчет (т.е. кто заплатил, а не с кем договор):
• физлицо - формируем,
• ЮЛ или ИП оплатил наличными или картой - формируем, в остальных случаях - нет.
И не имеет значения, с кем заключен договор.

В вашем случае: так как оплата кредита пришла от ЮЛ на расчетный счет, чек можно не формировать. Но, если вам нужно, чтоб в учете по данным с ККТ у вас все было аккуратно и кредиты, и оплаты кредитов сошлись, то чек сформировать можно - это не запрещено.

Хорошего дня