Добрый день, Юлия!
Контур.Экстерн подойдёт бухгалтерам, которым не требуется ПО для работы с первичными документами, которые формируют отчёты в других программах и хотят просто отправлять готовые файлы в контролирующий орган, или хотят вручную заполнить отчёт в программе, проверить и отправить.
Эльба - это сервис, в котором отчётность в контролирующие органы формируется автоматически на основе первичных бухгалтерских документов (счетов-фактур, актов, накладных и т.д.) с возможностью дальнейшей отправки. Возможности принять отчёт из файла или заполнить/отредактировать отчёт нет. Эльба ориентирована на ИП и ООО на спецрежимах (УСН, ЕНВД и ПСН) и позволяет работать в системе без специальных знаний в области бухгалтерского учета. Более подробно о возможностях и стоимости сервиса можно посмотреть на сайте сайте http://www.e-kontur.ru/#possibilities
Контур.Бухгалтерия подходит для совместной работы бухгалтера и директора небольшого предприятия на ОСНО, УСН, ЕНВД.  Одной из главных отличительных особенностей Контур.Бухгалтерии является возможность ведения бухгалтерского учета, т.е. формирование форм бухгалтерской отчетности (баланс и отчет о финансовых результатах), работа с бухгалтерскими проводками, формирование финансового анализа деятельности предприятия. Более подробно про сервис - на сайте http://www.b-kontur.ru/