Должна ли НКО на УСН с НДС выставлять счет-фактуру и платить НДС при оказании услуг в 2026 году, если аванс получен до перехода на НДС?

Question

Добрый день!

НКО заключило договор на оказание услуг по реализации программы по поддержке предпринимательству с другой АНО, которое является получателем субсидии из бюджета.

НКО на УСН (6%). Аванс по договору получило в ноябре 2025 года, с декабря стали плательщиками НДС, т.к. превысили лимит 20 млн.

Услуги будут полностью оказаны в июле 2026 года. Нужно ли выставлять счет-фактуры и исчислять НДС, соответственно вести книгу продаж, сдавать декларацию по НДС?

Алла Грешкина · Accepted Answer

Добрый день.

Если в течение 2025 года доходы плательщика УСН превысят 20 млн. рублей, то он становится плательщиком НДС с 1-го числа месяца, следующего за месяцем, в котором произошло указанное превышение (п. 5 ст. 145 НК РФ).

Порядок действий плательщика УСН, который стал плательщиком НДС (независимо от выбранной им ставки НДС) в отношении длящихся договоров разъяснен в п. 16 Методических рекомендаций, содержащихся в Письмах ФНС РФ от 17.10.2024 N СД-4-3/11815@, от 30.12.2025 N СД-4-3/11836@ «О направлении Методических рекомендаций по НДС для УСН 2026».
Согласно указанным разъяснениям, если плательщик УСН получил аванс в счет будущей реализации товаров (работ, услуг) в периоде, когда он не являлся плательщиком НДС, то НДС с полученного аванса не исчисляется и не уплачивается (п. 3 ст. 346.11 НК РФ). 
При реализации товаров (работ, услуг) в периоде, когда плательщик УСН уже стал плательщиком НДС, необходимо начислить НДС по выбранной ставке. 

Порядок начисления НДС зависит от того, согласится ли контрагент (покупатель, заказчик) на увеличение стоимости услуг на сумму НДС или нет. Для этого с контрагентом рекомендуется заключить дополнительное соглашение к договору, предусматривающее включение в стоимость товаров (работ, услуг) по договору суммы НДС или увеличение стоимости услуг на сумму НДС:
- если контрагент НЕ согласится внести изменения в договор и доплатить сумму НДС, то при реализации товаров (работ, услуг) необходимо исходить из того, что цена договора включает в себя НДС. В этом случае, применяется расчетная ставка НДС. 
- если контрагент согласится внести изменения в договор и доплатить сумму НДС, то при реализации товаров (работ, услуг) к стоимости услуг прибавляется сумма НДС.

Соответственно, если реализация происходит в периоде, когда плательщик УСН уже является плательщиком НДС, он должен выставлять счета-фактуры и сдавать декларацию по НДС (ст. 168 НК РФ, ст. 174 НК РФ).

Подробные разъяснения в материале Контур Экстерн: [Как работать со счетом-фактурой компаниям и ИП на УСН в 2026 году](https://www.kontur-extern.ru/info/54684-rabotat_so_schetom_fakturoj_na_usn)

С уважением, А. Грешкина

Должна ли НКО на УСН с НДС выставлять счет-фактуру и платить НДС при оказании услуг в 2026 году, если аванс получен до перехода на НДС?

Вопросы по теме